兔群可以使用真菌霉素，按250毫克千克体重口服，每天一次，连用三天。局部治疗时，清除患部的短绒毛，用温肥皂水洗去皮屑及痂皮，涂上酮康唑软膏、5%碘酊，每天两次。阿维菌素针剂皮下注射，七天一次，连用2～3次，同时在每吨饲料中添加100克灰黄

浅部真菌病主要包括皮肤癣菌感染、马拉色菌感染和念珠菌感染。深部真菌病包括皮下组织真菌病和系统性真菌病。其中皮下组织真菌病常见的有着色芽生菌病、孢子丝菌病等；系统性真菌病指真菌侵犯内脏器官，如隐球菌性脑膜炎、念珠菌性肺炎等。